Los certificados de distribución de iOS caducan para dos aplicaciones del mismo equipo: ¿Debo tomar medidas por separado?

Apple cubre sus próximos pasos en las FAQ - https://developer.apple.com/support/certificates/

Certificado de distribución de iOS (App Store)

Si tu membresía al Programa de Desarrolladores de Apple es válida, tus aplicaciones existentes en el App Store no se verán afectadas. Sin embargo, ya no podrás subir al App Store nuevas aplicaciones o actualizaciones firmadas con el certificado caducado o revocado.

Certificado de distribución de iOS (aplicaciones de uso interno)

Los usuarios ya no podrán ejecutar las aplicaciones que hayan sido firmadas con este certificado. Debe distribuir una nueva versión de su aplicación firmada con un nuevo certificado