Experiencia reciente
Por si sirve de algo, hace poco usé un MacBook Pro solitario durante una semana mientras el mío estaba en el taller. Como utilizo mi mac principalmente para desarrollar software para servidores unix (que suelen utilizar sistemas de archivos ext4 que distinguen entre mayúsculas y minúsculas), decidí volver a probar HFS+ que distingue entre mayúsculas y minúsculas.
En mi caso, todas las aplicaciones principales de OS X han funcionado perfectamente y no he notado ningún problema de estabilidad en el sistema. Además, la mayoría de mis programas de terceros funcionaron sin problemas.
Pero hubo excepciones. Cuando me decidí a probarlo, ya tenía en mente una serie de programas que esperaba que se rompieran, y unos cuantos lo hicieron. Lo más notable fue que todo el software de Adobe se negó a ejecutarse. Dado que Creative Cloud requiere que se instale en el volumen de arranque, un disco de arranque con mayúsculas y minúsculas es un obstáculo.
Sin embargo, por lo general, existen alternativas mejor construidas a estas frágiles bases de código. Por ejemplo, yo empecé a utilizar La afinidad de Designer y Photo en lugar de Illustrator y Photoshop, que se ajustan casi perfectamente a mis casos de uso.
Hubo algunas sorpresas agradables: Backblaze siguió funcionando y el Escritorio Remoto de Microsoft pudo seguir utilizándose.
No tengo ningún otro programa de Microsoft, así que no puedo opinar sobre las aplicaciones de Office, etc., que podrían ser un poco dudosas.
Mis planes
Una vez cada pocos años, reconstruyo totalmente mi sistema desde cero en lugar de actualizarlo. Estoy planeando hacer esto cuando El Capitán sea lanzado oficialmente, y yo se utilizar un sistema de archivos que distinga entre mayúsculas y minúsculas. Tal y como yo lo veo: cualquier software que no pueda ejecutarse distinguiendo entre mayúsculas y minúsculas probablemente no sea algo que quiera ejecutar en absoluto. Si hay algo que absolutamente necesario Siempre puedo ejecutarlo dentro de una VM de VirtualBox que no distinga entre mayúsculas y minúsculas.
[[Actualización 2015-10-15]]
Llevo más de 2 semanas con HFS+ Case Sensitive en El Capitán y no he tenido ni un solo problema. Por supuesto, ni siquiera me he molestado en instalar el software que sabía que no funcionaría (Adobe), pero no he tenido ningún problema con ningún software de Apple, aplicaciones de la App Store o código abierto. Si pasas una buena cantidad de tiempo desarrollando para sistemas unix, te recomiendo encarecidamente que des el salto.
[[Actualización 2016-09-23]]
Bueno, ya ha pasado un año y no pienso volver. Yo animaría a todos los desarrolladores a utilizar siempre un sistema de archivos que distinga entre mayúsculas y minúsculas. Además, hay que tener en cuenta que el sucesor de HFS+, APFS , se convertirá en el sistema de archivos por defecto para macOS, iOS y watchOS la próxima primavera, y por ahora solo está disponible como sistema de mayúsculas y minúsculas.