Un teclado Windows no necesariamente enviará las mismas combinaciones Fn que un teclado Mac. Una forma de probar que la propia Preferencia está cambiando es escuchar el pitido de error. Cuando usted presiona [real] F3 en Finder, debería emitir un pitido de error, porque no tiene ninguna función asignada. La función especial alternativa debería invocar Exposé, moviendo todas tus ventanas hacia fuera para que puedas verlas todas. Si mantienes presionada la tecla Fn para invocar esto depende de la forma en que esté configurado el prefijo. El prefijo cambia inmediatamente al marcarlo/desmarcarlo, ni siquiera es necesario cerrar la ventana.
Si sigue sonando en ambas configuraciones, es probable que el teclado esté enviando un mensaje equivocado.
Es difícil saber qué mensaje envían las teclas de función especiales porque se combinan en el teclado y actúan antes de que cualquier otra cosa en el ordenador pueda leerlas.
Prueba con Códigos clave (gratuito) de la App Store y prueba a ver qué aparece cuando pulsas F1 y Fn/F1. La tecla F 'verdadera' mostrará un código verdadero, la versión de Función Especial no mostrará nada, sólo hará la función especial. Si eso no es lo que ves en KeyCodes, entonces puedes estar bastante seguro de que tu teclado no está enviando algo sobre lo que el Mac pueda actuar.