0 votos

Traté de instalar gromacs 5.1.1 a través de homebrew, todos los comandos no se encuentran

He intentado instalar gromacs en mi sistema (10.11.5) a través de homebrew. El comando que utilicé fue brew install gromacs y parece que ha funcionado bien; gromacs está en mi usr/bin/Cellar y aparece cuando ejecuto brew list .

Pero, cuando trato de ejecutar cualquier comando de gromacs, sólo obtengo un error de comando no encontrado. Cuando intento ejecutar man gromacs me dice que no hay ninguna entrada de manual para gromacs; obtengo entradas de manual como es normal para otros paquetes de brew que estoy usando.

brew doctor El resultado está pegado abajo, pero nada de lo que hay ahí significa nada para mí. Apreciaría sus perspectivas sobre cómo hacer que esto funcione, o sobre qué otra información podría necesitar incluir.

Me pregunto si tengo que modificar mi PATH, pero si es así no sé cómo hacerlo o a qué modificarlo.

Saludos

salida del médico de la cerveza después de esto Warning: Unbrewed dylibs were found in /usr/local/lib. If you didn't put them there on purpose they could cause problems when building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

`

Unexpected dylibs: /usr/local/lib/libtcl8.6.dylib /usr/local/lib/libtk8.6.dylib

Warning: Unbrewed header files were found in /usr/local/include. If you didn't put them there on purpose they could cause problems when building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

Unexpected header files: /usr/local/include/fakemysql.h /usr/local/include/fakepq.h /usr/local/include/fakesql.h /usr/local/include/itcl.h /usr/local/include/itcl2TclOO.h /usr/local/include/itclDecls.h /usr/local/include/itclInt.h /usr/local/include/itclIntDecls.h /usr/local/include/itclMigrate2TclCore.h /usr/local/include/itclTclIntStubsFcn.h /usr/local/include/mysqlStubs.h /usr/local/include/odbcStubs.h /usr/local/include/pqStubs.h /usr/local/include/tcl.h /usr/local/include/tclDecls.h /usr/local/include/tclOO.h /usr/local/include/tclOODecls.h /usr/local/include/tclPlatDecls.h /usr/local/include/tclThread.h /usr/local/include/tclTomMath.h /usr/local/include/tclTomMathDecls.h /usr/local/include/tdbc.h /usr/local/include/tdbcDecls.h /usr/local/include/tdbcInt.h /usr/local/include/tk.h /usr/local/include/tkDecls.h /usr/local/include/tkPlatDecls.h

Warning: Unbrewed .la files were found in /usr/local/lib. If you didn't put them there on purpose they could cause problems when building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

Unexpected .la files: /usr/local/lib/libfftw3f.la /usr/local/lib/libfftw3f_threads.la

Warning: Unbrewed .pc files were found in /usr/local/lib/pkgconfig. If you didn't put them there on purpose they could cause problems when building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

Unexpected .pc files: /usr/local/lib/pkgconfig/tcl.pc /usr/local/lib/pkgconfig/tk.pc

Warning: Unbrewed static libraries were found in /usr/local/lib. If you didn't put them there on purpose they could cause problems when building Homebrew formulae, and may need to be deleted.

`

Unexpected static libraries: /usr/local/lib/libtclstub8.6.a /usr/local/lib/libtkstub8.6.a

1voto

Tsankara Puntos 1

Lo resolví yo mismo, así que publico la respuesta por si alguien más tiene este problema.

La respuesta fue que gromacs ha cambiado desde la versión que usé más recientemente, y los comandos a los que estaba acostumbrado ya no existen. Por ejemplo, el comando g_energy ahora se ejecuta como gmx energy .

Si usted también tiene este problema, gmx help commands debería darte una lista de lo que son los comandos ahora.

Gracias por leer esto.

AppleAyuda.com

AppleAyuda es una comunidad de usuarios de los productos de Apple en la que puedes resolver tus problemas y dudas.
Puedes consultar las preguntas de otros usuarios, hacer tus propias preguntas o resolver las de los demás.

Powered by:

X