En caso de que alguien siga viendo esto, iTerm2 3.3.6 tiene un error que puede hacer que la ventana emergente siga apareciendo incluso con ambas partes de Respuesta de dpk aplicada (es decir, con el clic forzado desactivado, así como la búsqueda en el diccionario establecida en No).
https://gitlab.com/gnachman/iterm2/issues/5842
Yo soy una de las personas a las que esto no les soluciona nada. (Estoy en Mojave 10.14.6 en un MBP de 15" de 2017, por cierto).
Según la página de problemas, se puso otra solución en la 3.3.7 (la última versión en el momento de escribir este artículo), pero parece que ni siquiera eso lo ha solucionado para todos. La última beta de la versión 3.3.8 tiene otro intento de solucionarlo.
Acabo de encontrar el problema anterior, y aún no he probado la 3.3.7 ni la 3.3.8 beta para ver si me lo soluciona. Esta es la característica más molesta de mi Mac con diferencia, así que probablemente probaré la beta 3.3.8 pronto, e informaré aquí si lo hago (y cuando la 3.3.8 salga de la beta.)
10/28/2020
Al parecer, me olvidé de informar a tiempo. Algo sobre un nuevo virus... La versión 3.3.8 beta sí que lo arregló. Ahora estoy en la 3.3.11 (y Catalina) y no hay señales de regresiones, así que bien hecho equipo iTerm2. A la tercera fue la vencida.