¿Existe una app que me notificará (en el centro de notificaciones) si un proceso está utilizando un porcentaje alto de la CPU durante un período determinado de tiempo?

Puede ejecutar un script como este cada minuto con cron o launchd:

#!/bin/bash

cpulimit=50
prefix=${TMPDIR}cron_cpu
current=$(ps -erco %cpu,command | tail -n+2 | sed 's/^ *//')
echo "$current" > $prefix$(date +%s)
a=($prefix*); for ((i=0;i<=${#a[@]}-3;i++)); do rm "${a[i]}"; done
[[ $(awk '{s+=$1}END{printf "%i",s}' <<< "$current") -lt $cpulimit ]] && exit
averages=$(awk '{cpu=$1;sub(/[^ ]+ /,"");a[$0]+=cpu;c[$0]++}END{for(i in a){printf "%.1f %s\n",a[i]/c[$0],i}}' $prefix* | sort -rn)
if [[ $(awk '{s+=$1}END{printf "%i",s}' <<< "$averages") -ge $cpulimit ]]; then
    terminal-notifier -title "CPU use" -message "$(head -n5 <<< "$averages" | paste -sd / -)"
fi

Si el promedio de uso de la CPU en los últimos tres muestras de más de 50%, se utiliza el terminal-notificador para mostrar los procesos que utiliza la mayoría de la CPU.

Usted podría también utilizar MenuMeters para mostrar el total de uso de la CPU en la barra de menú:

O ejecutar un script como este con GeekTool:

for i in {1..4}; do ps -erco %cpu,command | tail -n+2; sleep 1; done | sed 's/^ *//' | grep -v GeekTool | awk '{cpu=$1;sub(/[^ ]+ /,"");a[$0]+=cpu;c[$0]++}END{for(i in a){printf "%.1f %s\n",a[i]/c[$0],i}}' | sort -rn