¿Cómo puedo eliminar los espacios en blanco iniciales y finales de los nombres de archivo en Automator?

Hay una línea script para eso, cd a esa carpeta y ...

for f in *; do mv "$f" "$(echo $f)"; done

Ponerlo en un shell script y llamarlo desde Applescript:

tell application "Terminal"
    do script "whatever"
end tell

Para una respuesta correcta que se base en la de Tuan se necesita lo siguiente, que no sólo renombrará el archivo sino que también conservará la cadena de acciones para las acciones siguientes.

Ten en cuenta también que no queremos renombrar la carpeta padre de ninguna manera, sólo los archivos.

for f in "$@" ; do
    dirname=$(dirname "$f")
    basename=$(basename "$f")
    name=${basename%.*}
    ext=${basename##*.}
    name="$(echo "$name" | sed -Ee 's/^ +//;s/ +$//')"
    new="$dirname/$name.$ext"
    mv "$f" "$new"
    echo "$new"
done

Tampoco es necesario poner esto en un shell script propiamente dicho, automator puede tenerlo incrustado en la acción "Ejecutar Shell script".

También quería eliminar los espacios en blanco de los nombres de archivos y carpetas. Este puesto de superusuario me ayudó.

Hay un AppleScript (muy similar a Automator) que recorta los nombres de los archivos. Es un poco largo, así que no puedo publicarlo aquí, pero aquí es un enlace al código. Asegúrate de leer la parte inicial del código, ya que explica lo que hace el script y cómo funciona.