Para responder a su pregunta, hay un buen paquete de software de Windows para leer y escribir en APFS Sin embargo, no necesitas esto y ninguno parece permitir la partición o la configuración como pides.
El instalador autónomo sabe lo suficiente como para ejecutar Disk Utilty y preparar una unidad, por lo que no necesita una unidad formateada. Cuando se ejecuta el instalador detectará la unidad desnuda y ofrecerá borrar, formatear, particionar e instalar el sistema operativo.
Sólo hay que arrancar el instalador y conectar el nuevo disco. Puede estar conectado internamente o externamente y el instalador hará el borrado y el formato correctos por ti.
Su Mac podría incluso ser capaz de arrancar con la recuperación de Internet para que la Utilidad de Discos particione el disco con cero SO o instaladores locales de arranque. Aquí hay una guía paso a paso que Apple mantiene actualizada para este procedimiento.