¿Redactar imágenes en Vista Previa utilizando formas opacas elimina los datos originales del archivo de imagen resultante?

Archivo png de una sola capa

Sí, siempre y cuando se guarde en .png o .jpg - algo que no guarde las capas.
Técnicamente, png puede usar capas, pero Vista Previa no lo hace.
Una vez que se aplana a una sola capa, la información que hay debajo ya no existe.
Tenga en cuenta que, debido a una peculiaridad de edición de Vista Previa, su objeto de redacción sigue siendo movible incluso después de guardar la imagen, pero la versión guardada ya es una sola capa. Si cierras y vuelves a abrir verás que la capa editable sólo estuvo presente "en vivo" en Vista Previa durante el tiempo que el original estuvo abierto.

Esto no funcionará de forma fiable en un pdf. El elemento utilizado para redactar seguirá siendo un objeto móvil, si no en Vista Previa, entonces en alguna aplicación de terceros. Los diferentes visores de pdf respetan diferentes niveles de seguridad y siempre puedes encontrar uno que se salte cualquier seguridad que intentes implementar.

Captura de pantalla en png del original PDF de varias capas.

Tu razonamiento es correcto: en los PDF, no puedes redactar así, el texto sigue estando presente. Pero con formatos de píxeles puros como PNG, JPEG, BMP, etc., dibujar sobre el texto borrará la información original, no será recuperable si utiliza un color 100% opaco .