Nada en absoluto. Cualquier caché que se requiera se recreará en el próximo reinicio. Limpio mis cachés de vez en cuando como una cosa OCD, pero no es necesario. Un caché es sólo un archivo temporal. Si lo borras, las aplicaciones lo recrearán cuando sea necesario.
En la época de los discos duros se necesitaban cachés para acelerar la carga de las aplicaciones. En los SSD no son tan importantes, pero son un legado y probablemente no desaparecerán pronto. Puedes seguir borrándolas, pero siempre volverán. No te preocupes por si algo va mal. Una aplicación bien escrita es lo suficientemente inteligente como para no guardar ninguna configuración en una caché, por lo que no tendrás que preocuparte de perder información.
Bórralos todos si quieres. Los que tus aplicaciones necesiten simplemente se recrearán. Si estás en un disco duro, notarás una ralentización durante un tiempo mientras las aplicaciones recrean la caché. Pero en un SSD no notarás nada.