¿Cómo desactivar Cmd+Shift+A y Cmd+Shift+M desde la CLI en MacOS?

En Ventura, esto está en una nueva ubicación Configuración del sistema / Teclado / Accesos directos de teclado... / Servicios / texto

:

Cuando deshabilitas estos atajos de teclado a través de la interfaz de usuario, estás efectivamente añadiendo el siguiente par clave-valor al diccionario NSServicesStatus en el dominio pbs:

"com.apple.Terminal - Search man Page Index in Terminal - searchManPages" = {
  "enabled_context_menu" = 0;
  "enabled_services_menu" = 0;
  "presentation_modes" = {
    ContextMenu = 0;
    ServicesMenu = 0;
  };
};

Para hacerlo a través de la CLI, puedes escribir en forma codificada en XML usando -dict-add:

VALUE='enabled_context_menuenabled_services_menupresentation_modesContextMenuServicesMenu'

defaults write pbs NSServicesStatus \
  -dict-add \
  'com.apple.Terminal - Open man Page in Terminal - openManPage' \
  "$VALUE"
defaults write pbs NSServicesStatus \
  -dict-add \
  'com.apple.Terminal - Search man Page Index in Terminal - searchManPages' \
  "$VALUE"

No existe un comando (documentado) para eliminar un elemento clave de un diccionario, pero puedes reemplazar una clave de diccionario existente:

defaults write  -dict-add "Insert Bookmark" -string "@^b"

donde @ es para la tecla Command, ^ es CTRL, $ es para shift, y ~ es para Alt.

Por lo tanto, necesitarás proporcionar otra secuencia de teclas que no vayas a utilizar. Obviamente, tendrás que averiguar cuál es el archivo.