Realmente no puedo responder por qué es tan ineficiente, pero he tenido el mismo problema, y tengo alrededor de ella mediante el uso libre de Cuarzo filtros de Jerome Colas.
Este post en los foros de discusión de Apple tiene los detalles, pero el enlace está roto, un extra * en el final se rompe, debe ser https://public.me.com/jcolas.
Descargar, descomprimir, y añadir los "Filtros" de la carpeta a la carpeta de la Biblioteca.
Para usar, abrir un archivo PDF en vista previa, haga clic en Archivo > Guardar Como y, a continuación, seleccione Filtro Quartz, y el nivel de compresión.
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Creo que Jerónimo está exponiendo algo que ya existe en OSX, pero sin duda, es una buena solución que funciona bien para mí, lo que me permite obtener un buen equilibrio entre calidad y tamaño de archivo.