Tengo el problema de que mis ventanas no son realmente de altura completa en OS X. Soy nuevo en OS X así que no sé si esto es nuevo.
He aquí una imagen de ejemplo:
Observa los pocos píxeles inferiores, el fondo sólo se muestra ahí, porque la ventana termina. Obviamente, esto no es el modo de pantalla completa para Windows como en un espacio separado, pero esto es la maximización con la tecla de opción.
Estoy en un MacBook Pro Retina de principios de 2013, si eso es relevante. Estoy usando la escala más pequeña así que 1650x1050
Edición: El cambio de escala no ha solucionado el problema.