No sé si tu pregunta se refiere al aspecto técnico de la sustitución de las llaves, o a los pros y contras generales de hacerlo. Pero una cosa que tal vez quieras considerar son los atajos de teclado si los usas. Copiar y pegar, guardar, seleccionar todo, etc., son fáciles de usar en un teclado QWERTY, pero puede que no lo sean en la distribución a la que quieras cambiar.
Por supuesto, acostumbrarse a una distribución de teclado poco común también significará que tendrás problemas para escribir en los teclados QWERTY de otras personas, aunque sólo si te relacionas a menudo con otras personas y sus ordenadores.
En cuanto al proceso de sustitución de las llaves: no debería haber ningún problema. La gente lo hace todo el tiempo y hay un montón de guías y videoguías por ahí para mostrarte cómo hacerlo. Por ejemplo: Sustitución del teclado del MacBook Pro/PowerBook (Parte 1 de 3) o Cómo: Reemplazar o limpiar las teclas del teclado de tu MacBook, MacBook Pro o Macbook Air
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