La mejor manera de experimentar el "¿cómo empezar de cero," sin partir de cero es crear un nuevo usuario vacío, retire todos los "elementos de inicio de sesión" y trabajar desde allí. Tan cerca como usted puede conseguir. Por supuesto, hay otros factores que puede haber instalado y puede estar ralentizando su sistema (extensiones viejas, drivers, etc que puede ser el registro en exceso, servicios defectuosos, etc.).
Si usted hace una instalación limpia (y tener una copia de seguridad en otra unidad), "manualmente" la migración no es que los malos. Usted tendrá que:
Arrastre sus aplicaciones de Old_Drive a la New_Drive (una buena oportunidad para no arrastrar esas cosas viejas que ya no usas) :)
Antes de comenzar a ellos, encontrar en ~/Library y migrar Preferencias y Soporte de Aplicación para las aplicaciones que quieras conservar (aunque a veces se destruyera las preferencias es un buen comienzo fresco).
También revisa /Biblioteca/Preferencias de la Aplicación y todas las bibliotecas en general.
Copiar tus Documentos, Música, Imágenes, Películas, etc. (Otro gran momento de dejar las cosas viejas detrás).
Volver a configurar el nuevo equipo también, de la red, su muelle, el buscador de valores, el fondo de escritorio, etc. Todas esas cosas.
En lo que respecta a su pregunta específica, "la mitad correcta" en mi experiencia. He actualizado a partir de 10.3->10.4->10.5 pero luego Snow Leopard reapareció, aunque yo iba a Actualizar, mi coche se estrelló y yo decidimos que era un buen momento para empezar de nuevo. Yo tenía copias de seguridad, pero no tenía ganas de migrar (debido a la Migración de asistencia no dejar que elegir las aplicaciones individuales es un todo o nada) y me había copias antiguas de Photoshop y esas cosas que yo no quería detrás.
También las Diferencias entre los "Snow Leopard" fue "enorme" en términos de sistema operativo subyacente, así que parecía una buena idea.
Es un dolor en los dos primeros días, pero luego rápidamente se empiezan a hacer las cosas de nuevo y, para citar la película El Abismo: "el cuerpo va a recordar". ;)
Otra cosa que puede o puede no ser molesto, dependiendo de su software, es que tendrás que volver a registrar algunas aplicaciones, pero tiene 1Password con todas sus licencias, ¿no? :)
Por último, no debe hacer esto sin tener una copia de seguridad (clon de arranque) de su unidad actual, por si acaso. Una Máquina del Tiempo es "ok" pero no sólo confiar en que como el proceso de recuperación es mucho más lenta que la de un simple arranque de la unidad nueva :) Así que si usted tiene un clonado de la unidad, siempre se puede volver a instalar y ver por ti mismo, si no te gusta, clonar su disco de regreso.
Buena suerte!
P. S.: Para responder directamente a sus inquietudes: Usted no debería tener mucho problema con los permisos, nada que usted no puede realmente "fuerza" y la revisión y preferencias... bueno... todos ellos hasta que empieza a copiar cosas de nuevo! :)