¿Hay alguna forma de modificar los glifos dentro de Caracteres Especiales y Emoji?

Demasiado largo para un comentario pero aún no suficiente para una respuesta

No sé por qué entre los miles de glifos unicode existentes no se puede encontrar uno que sea suficiente.

Un glifo se llama desde una fuente. Si la fuente actual no tiene el glifo, el sistema operativo proporciona un sustituto de otra fuente que hace . [No sé cómo funciona ese mecanismo, pero yo solía trabajar de apoyo en un juego multiplataforma en el que los subs funcionaban en Windows pero no en Mac, aunque el Mac podía usar los glifos en cualquier otra aplicación].

Por lo tanto, es necesario crear una fuente, aunque sólo contenga un glifo, en un espacio de direcciones que no esté en uso actualmente [1] , entonces regístralo en el OS . y luego proporciona algún mecanismo para poder escribirlo, por ejemplo, desde Keyboard prefs > Text.

[1] no puedes reemplazar la 'e', o cualquier otro carácter ya utilizado, o sólo conseguirás que se muestre si cambias manualmente el tipo de letra para ese carácter - lo que no puedes hacer para un nombre de archivo.

Usted puede utilizar algunos glifos existentes en los nombres de los archivos, que deberían aparecer en cualquier Mac [Windows no sabría decir]
El lugar donde se archiven dependerá quizás de su numeración Unicode. No estoy seguro de cómo probar esto a fondo.
Ejemplo ampliado con algunos glyps bastante aleatorios

Mencionas "glifos personalizados como etiquetas para los iconos". No estoy seguro de entender lo que quieres decir con eso, pero si estás tratando de modificar el icono de un archivo o directorio en Finder, aquí está cómo:

1. Crea la imagen que quieres que tenga el artículo.
2. Seleccionar y copiar toda la imagen en el portapapeles
3. Seleccione el elemento que desea modificar.
4. Obtener información (Cmd-I)
5. Haga clic en el icono de la parte superior izquierda de la ventana de información para seleccionarla.
6. Pegar para reemplazar.