Ya lo has hecho. Al borrar el disco has cambiado su UUID, por lo que TM ya considera que el nuevo disco no tiene ninguna relación con el antiguo.
El único problema con el que te puedes encontrar es que si alguna vez haces una restauración de disco completo desde una de tus antiguas copias de seguridad, TM parcheará las cosas para que el disco restaurado (que ahora tiene un tercer UUID) sea considerado como aquel del que provenían todas las antiguas copias de seguridad. Ahora serán las nuevas copias de seguridad las que no se borrarán nunca.
Lo cual, pensándolo bien, es probablemente lo que quieres.
En caso de que esto sea confuso, pongamos un ejemplo concreto. Tienes un disco con UUID#1, y en marzo empiezas a dejar que TM haga un montón de instantáneas con él. TM recuerda que son instantáneas de UUID#1. Luego, en junio, borras el disco, de modo que ahora tiene UUID#2 y dejas que TM empiece a hacer instantáneas con él. TM considera que las instantáneas de junio en adelante son instantáneas de un disco diferente de un ordenador diferente. No tocará las instantáneas de marzo-abril.
Luego, en agosto, se hace una restauración del disco completo a partir de una de las instantáneas de abril. Parte de la restauración del disco completo es borrar el disco, por lo que ahora tiene UUID#3. Pero al final de la restauración, TM parchea la copia de seguridad para que las instantáneas de marzo-abril parezcan haber sido del disco con UUID#3. Las instantáneas de mayo-junio, del disco con UUID#2, son ahora las protegidas que TM no tocará.
Personalmente, sin embargo, dejaría que TM empezara a hacer copias de seguridad en un disco nuevo. Eso hace que sea más fácil para usted para realizar un seguimiento de qué copia de seguridad es de qué disco, y reduce el riesgo de que usted va a perder las viejas copias de seguridad a un fallo de la unidad. El fallo de la unidad parece ser la mayor amenaza para una copia de seguridad de TM. Si no estás usando las copias de seguridad antiguas, no necesitas tenerlas montadas todo el tiempo.