Formato AAC a 256 kbit/s, m4a
Originalmente, las canciones se codificaban con flujos AAC de 128 kbit/s codificados por FairPlay en una envoltura mp4, utilizando la extensión .m4p.
Desde el 29 de mayo de 2007, las canciones del sello EMI están disponibles en un formato sin DRM llamado iTunes Plus. Estos archivos no están protegidos y están codificados en el formato AAC a 256 kbit/s, el doble de la tasa de bits de las pistas estándar compradas a través del servicio. En iTunes se etiquetan como "archivo de audio AAC comprado" (.m4a) en lugar de "archivo de audio AAC protegido" (.m4p).
En enero de 2009, Apple anunció que toda la música estaría disponible en el formato iTunes Plus, poniendo fin a la venta de música con DRM en iTunes. En abril de 2009, la venta de música protegida terminó en las versiones occidentales de la tienda, convirtiendo toda la música de iTunes Store en "iTunes Plus". Los usuarios de iTunes Store pueden optar por "actualizar" cualquier música descargada de iTunes a iTunes Plus si lo desean, pero la mayoría de las canciones requieren un pago para hacerlo. La música protegida por FairPlay DRM seguía estando disponible en la tienda japonesa de iTunes, hasta el 22 de febrero de 2012, cuando se actualizó al modelo iTunes Plus[105].
En septiembre de 2009, Apple introdujo el formato iTunes LP (conocido antes de su lanzamiento con el nombre en clave "Cocktail")[106], que incluye contenidos visuales e interactivos junto a las pistas y las letras de los álbumes.