En mi experiencia, las tiendas de Apple realmente no suelen hacer ese tipo de trabajo, puede que sea mejor llevarlo a un centro de servicio autorizado para ese tipo de cosas.
Puedes usar Monitor de Actividad (que se encuentra en la carpeta de Utilidades) para monitorear la actividad del disco. Esto te dará una idea de qué tan rápido el disco está transfiriendo datos a y desde sus platos. Luego tendrías que investigar para ver si el rendimiento que estás obteniendo es inferior al normal o normal.
Otra cosa que puedes verificar sería el uso de la CPU y la RAM, verificar esto cuando el sistema está funcionando mal puede darte una idea de qué es lo que te está ralentizando (asumiendo que es algún software el que está consumiendo toda tu CPU/RAM).
También puede valer la pena revisar la Consola (también se encuentra en la carpeta de Utilidades) para ver si alguna aplicación o servicio está enviando muchos mensajes (de error), estas aplicaciones/servicios pueden estar causando ralentizaciones al consumir recursos del sistema.
Otro paso de solución de problemas (mucho menos inocuo) podría ser hacer una instalación de archivo de tu sistema (lo que básicamente mantiene todos tus archivos y configuraciones pero instala una copia nueva del sistema) y ver si mejora el rendimiento.