A diferencia de la música y las fotos, no hay (parece ser, en mi opinión) una opción de sincronización integrada para iMovie. Es posible que tenga que utilizar un programa como iExplorer para obtener los archivos del proyecto real del dispositivo IOS, pero una vez que los tiene no hay garantía de que serán utilizables en cualquier aplicación (Mac o Windows).
Si pulsas el botón de compartir en iMovie, podrás guardar el proyecto final como un archivo de película directamente en el rollo de la cámara, que se sincronizará con tu PC la próxima vez que sincronices tu dispositivo. Pero por tu pregunta parece que quieres una copia de seguridad de todos los archivos individuales contenidos en cada proyecto de iMovie.
Apostaría a que una copia de seguridad de tu iPhone contiene todos esos archivos, pero al no haber utilizado nunca iMovie en un dispositivo IOS no puedo decirlo con autoridad. Pero de nuevo una aplicación como iExplorer le permitirá (ejem...) explorar las copias de seguridad en su PC para verificar y extraer esos archivos.