Yo uso el último OS X El Capitán en el MacBook Pro Retina, y tenía este problema desde Yosemite.
Cuando intento seleccionar un archivo para subirlo en el navegador (el mismo problema en Safari y Chrome, pero no en otras aplicaciones como Photoshop) - se OCULTAN todas las carpetas cuando hago clic en cualquier etiqueta de color en el panel lateral. Las carpetas desaparecen justo después de medio segundo. Por lo tanto, puedo seleccionar un archivo etiquetado pero no puedo ir a la carpeta etiquetada y seleccionar un archivo allí.
He intentado eliminar com.apple.finder.plist, también he intentado crear un nuevo usuario, pero el problema persiste :(
