Necesito ayuda para actualizar Xcode

Existe la posibilidad de que sea el almacenamiento local de Time Machine; aunque yo usaría algo como GranPerspectiva para ver qué es lo que ocupa más espacio.

Si se trata de copias de seguridad locales...

Desactivar el almacenamiento local de copias de seguridad de Time Machine

Aquí se explica cómo desactivar las copias de seguridad locales:

Inicie Terminal desde /Aplicaciones/Utilidades
Introduzca el siguiente comando:
sudo tmutil disablelocal

Introduzca la contraseña de administrador cuando se le pida que desactive las copias de seguridad locales

Reactivar las copias de seguridad locales de Time Machine

sudo tmutil enablelocal

Recuerde que si desactiva esta función ya no tendrá copias de seguridad locales, por lo que si algo va mal no tendrá suerte. Es importante tener copias de seguridad periódicas de tus datos, por lo que si vas a desactivar esta función asegúrate de seguir utilizando Time Machine, quizás incluso iniciando una copia de seguridad manual antes de desconectar la unidad, para conservar una copia reciente de tus datos.

Fuente: http://osxdaily.com/2011/09/28/disable-time-machine-local-backups-in-mac-os-x-lion/

En cuanto a las descargas temporales
Deberían limpiarse automáticamente, pero si te sientes valiente y quieres escarbar [con mucho cuidado] en el sistema de archivos, viven en lo más profundo /private/var/folders/
Yo usaría algo como EasyFind (freeware) para buscar la cadena com.apple.appstore en Archivos y carpetas invisibles, y buscar dentro de las coincidencias de las carpetas modificadas más recientemente (haz doble clic en una de las carpetas encontradas para abrirla en el Finder).
Pero Yo tendría mucho cuidado de estar absolutamente seguro de lo que estás haciendo allí - no sé si las descargas parciales serán obvias y en texto claro. Yo no tocaría nada con un nombre insondable.