Cada vez que se ejecuta una copia de seguridad, Time Machine dice "Preparando copia de seguridad...". Durante esta etapa, busca qué archivos han sido cambiados desde la última copia de seguridad comparando los cambios en el Registro de Eventos (supongo) con su caché de archivos en el sistema.
Debido a la caché, la etapa de Preparación suele ser bastante rápida (30 segundos), pero por alguna razón, a veces cuando reinicio desde Boot Camp (Windows 7) en OS X, la caché de Time Machine se limpia o se corrompe. Lo sé porque la etapa de Preparación tarda 10 minutos después de arrancar de nuevo en OS X.
Por eso me pregunto dónde se encuentra el caché para poder determinar por qué a veces se corrompe.