Como soy del equipo de iPhone Backup Extractor, debo señalar que la versión gratuita del software sólo extrae cuatro registros de cada categoría (contactos, sms, fotos, etc.) cuando se utiliza en modo simple. La limitación en la extracción podría ser la razón por la que sólo encontraste cuatro contactos en tu copia de seguridad al utilizarlo.
La aplicación te mostrará exactamente cuántos contactos se detectaron en la copia de seguridad de iTunes en "Datos disponibles", en la sección "Contactos" (es el número que se muestra en azul).
Además, puedes ver cuántas copias de seguridad tienes y cambiar desde el menú desplegable de qué copia de seguridad quieres extraer. Si realmente sólo hay cuatro contactos en esa copia de seguridad, intenta ver si hay otras copias de seguridad anteriores que contengan los datos que buscas.
Incluso cuando las copias de seguridad están corruptas o dañadas de alguna manera, si los datos existen y no se han sobrescrito, es posible recuperarlos. Sugeriría contactar con el equipo de atención al cliente de iPhone Backup Extractor (support@reincubate.com) si todo lo demás falla - tenemos cuatro años de experiencia trabajando con copias de seguridad de iTunes y hemos ayudado a muchos usuarios a recuperar sus datos, quizás podamos hacer lo mismo por usted.