Puede hacerlo con un AppleScript. Utiliza el editor script de la carpeta Utilidades. Aquí tienes un script que he escrito para ti ahora mismo. Funciona en una carpeta a la vez - no la carpeta de nivel superior, pero la de su ejemplo que es 3587915.
Cuando ejecutas este script te pide que elijas una carpeta. En este ejemplo abrirías 3587915 y luego harías clic en "Elegir". Muy importante: no elijas la 3589919. Sólo estamos trabajando en una carpeta a la vez aquí. Si esto funciona para usted, podemos ampliar a un bucle a través de las carpetas en la carpeta de nivel superior.
tell application "Finder"
set the_folder to choose folder
set the_folder_name to name of the_folder
set the_subfolders to every folder in the_folder
repeat with I from 1 to count of the_subfolders
set name of every file of item I of the_subfolders to the_folder_name & "_" & I & ".pdf"
move every file of item I of the_subfolders to the_folder
end repeat
--
-- optionally delete the subfolders
delete every folder in the_folder -- put two dashes in front of this line to comment it out
end tell
Aquí hay capturas de pantalla que muestran cómo funciona. Deberías practicar con un conjunto de carpetas que no tengan importancia al principio. Puedes ver mi configuración inicial en la primera imagen y el resultado en la segunda. Los títulos de las imágenes no se muestran (para mí) así que aquí es lo que deberían ser:
Imagen 1: Servicio Automator, con AppleScript ligeramente modificado.
Imagen 2: la carpeta_1, la carpeta_2, la carpeta_3, la carpeta_4 y la carpeta_5 tienen cada una un solo pdf. Aquí sólo se muestra el contenido de la carpeta_1.
Imagen 3: Este es el resultado. Las subcarpetas han desaparecido. Los archivos tienen el mismo nombre que la carpeta principal.
Puedes guardar el script como una aplicación. O bien, puede ejecutar el script dentro de un paso en Automator ya que Automator puede ejecutar un AppleScript. Eso está en la sección de Utilidades de Automator, "Ejecutar AppleScript". Incluiría una imagen pero soy nuevo aquí y sólo se me permiten dos imágenes hasta que me actualicen.
Si quieres hacerlo con un servicio, usas casi el mismo script, pero tienes que pasar la carpeta control-clic. En lugar de usar el paso de AppleScript "Elegir carpeta", le dices a tu servicio de Automator que "reciba la carpeta seleccionada en el Finder" y pones "la_carpeta" como elemento 1 de la entrada. Vea la primera imagen. ¡Funciona como un campeón aquí!