No, esto no funcionará.
No es de los conectores de lo que te tienes que preocupar, es de la ubicación de los agujeros de los tornillos y Apple tiene fama de cambiar este detalle tan pequeño pero tan crítico para evitar que ocurra exactamente esto.
Por ejemplo, acabo de terminar de restaurar un MacBook de mediados de 2007 (blanco). Pedí una carcasa inferior (catalogada incorrectamente como de 2007) y, aunque todos los conectores estaban alineados correctamente, no entraba debido a diferencias muy sutiles en la ubicación de los postes de soporte y los agujeros para los tornillos, a veces de tan solo un par de milímetros.
¿Podrían ser diferentes las clavijas?
Por supuesto. Apple realiza cambios todo el tiempo en función de los componentes que adquiere. Los MacBook Pro a los que te refieres podrían tener un problema en el que los pines son diferentes. Después de todo, son los modelos MacBook Pro de 2016 los que sufrieron el problema del "flexgate" (cable de la pantalla), mientras que los de 2015 no lo sufrieron. El cable se acortó y los pines de alimentación de la luz trasera (21V) se acercaron demasiado a un pin de datos (3V), lo que dio lugar a máquinas que tenían GPUs fritas.
Mi consejo es que hagas reparar el SSD. Hay empresas que hacen reparaciones a nivel de placa por el mismo precio que pagarías por una placa lógica diferente.