Según la Mapa de teclas de PyCharm para Mac, Control + Flecha arriba y Control + Flecha abajo se utilizan para navegar entre los métodos anterior y siguiente. OSX, por supuesto, utiliza estos combos de teclas para (Control + Teclas de flecha) para navegar entre aplicaciones.
¿No hay otra solución aparte de reasignar estas teclas en OSX o en PyCharm?