Estoy experimentando este problema de vez en cuando. Por ejemplo, después de haber añadido imágenes a mi biblioteca Photos.app y luego reiniciar Photos.app (por cualquier razón). El problema parece ser, que spotlight empieza a hacer la indexación en el directorio de la biblioteca de fotos y se lía con Photos.app... Si esperas un par de minutos el problema debería desaparecer por sí solo. En mi caso reiniciar Photos.app no ayuda, reiniciar mi Mac no ayuda, expulsar y volver a montar el disco duro externo tampoco ayuda. Lo único que funciona es esperar.
Si tu disco externo es lento, o si has añadido montones y montones de fotos, puede tardar más.