Tengo un Macbook Air con OS X EL Capitan 10.11.6, cuando uso una aplicación como Safari o el correo electrónico y demás, en modo pantalla completa la aplicación funciona muy bien. Pero cuando cierro la app y reinicio el mac veo esto: 
o
Gracias por su ayuda.
Leo este y parece ser un problema que ocurre cuando CMD+Q es brutalmente empujado a cerrar una aplicación que no es de Apple.
Sustancialmente, supongo que debe ser un error del programa que estás cerrando y por eso -tal vez- tengas que esperar una actualización de corrección de errores por parte del desarrollador de la App en cuestión.
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