No creo que haya una forma nativa de hacer esto, pero podrías configurar reglas del lado del servidor (a través de Outlook Web Access, del lado del servidor para que siempre se procesen) para reenviar mensajes particulares a un servicio de notificaciones, como Boxcar (www.boxcar.io), y luego configurar sonidos individuales usando su aplicación para iOS.
Aquí hay una página que muestra cómo configurar las reglas de reenvío en OWA (elegido al azar a través de Google): http://programs.cocc.edu/OWA/FW/default.aspx
Una de las pegas de esto es que, por lo que sé, la funcionalidad de Reglas sólo está disponible en Internet Explorer, al menos con Exchange 2007. He probado esto en Chrome y Safari en mi Mac en casa y la opción no está disponible. He oído que la compatibilidad con navegadores que no son IE es mejor para Exchange 2010. Si no tienes acceso a IE, busca un poco en Google para ver si puedes encontrar algún consejo para usar IE 8 o 9 en OS X. Yo encontré uno, pero no estoy muy seguro de su legitimidad, así que decidí no publicar un enlace.