OS X 10.11.5 se cuelga ocasionalmente durante 30 segundos en la multitarea, los gestos y el Dock

No te preocupes, no eres sólo tú. Muchos usuarios de Mac están experimentando este mismo problema, incluido yo. Se cree que es un error de la versión 10.11.4 y te sugiero que actualices a la 10.11.5 o que hagas un downgrade (si tienes una copia de seguridad) a la 10.11.3.

En mi caso, no he tenido ningún problema o congelación desde que actualicé a 10.11.5. Funciona muy bien.

Ver: http://www.macrumors.com/2016/05/13/macbook-pro-system-freezes-os-x-10-11-4/

Apple publicó recientemente un aviso sobre la congelación de los MBP Retina de 13": https://support.apple.com/en-us/ht206594

Puedes empezar a comprobar cuál es la causa con el monitor de actividad y los registros del sistema.

• Launchpad > Otros > Consola
• Launchpad > Otros > Monitor de actividad

Comprueba qué está ocupando toda tu memoria. Tengo una aplicación para limpiar la memoria llamada FreeMemory Pro que comprueba si la memoria es baja, cuando es baja libera memoria, pero al hacer esto todo se congela ya que esto toma toda la memoria para limpiar otra memoria ya que puse el algoritmo en agresivo y no en clásico.

Así que esto es lo esperado, tal vez hay una aplicación en el fondo que está haciendo lo mismo que usted no sabía. Echa un vistazo a la Consola y al Monitor de Actividad y avísanos. :)