La gran mayoría de los programas de OS X son en realidad paquetes; si abres el terminal y navegas hasta la carpeta de aplicaciones, verás que tus aplicaciones son en realidad directorios (carpetas). En su interior hay varias bibliotecas, ejecutables, archivos de recursos, etc.
Para desinstalar se suele... normalmente ...sólo tienes que arrastrar la aplicación a la papelera y vaciarla. A continuación, haz una búsqueda desde el cuadro de texto de Spotlight (creo que es un desplegable de la lupa en la esquina) y busca el nombre de la aplicación para encontrar cualquier archivo .plist en la(s) carpeta(s) de la biblioteca; esas son las preferencias. También puedes arrastrarlos y soltarlos en la papelera. Entonces la aplicación debería desaparecer.
Digo normalmente porque algunas aplicaciones usaron instaladores cuando las pusiste, y a veces esos instaladores pueden, cuando se vuelven a ejecutar, desinstalar el programa. La mayoría, sin embargo, se puede eliminar como se ha descrito anteriormente, especialmente si lo instalaste arrastrándolo a la carpeta de aplicaciones en primer lugar.
Si la fastidias de alguna manera, siempre puedes reinstalar la aplicación y buscar un archivo README en el volumen DMG del instalador. He visto un montón de aplicaciones que vienen con un README sólo para decirte que arrastres la aplicación a la papelera para desinstalarla.
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No existe una API tan fantástica para gestionar limpiamente la instalación de aplicaciones en Windows o en MacOS X. Este paradigma se aborda con entornos de puertos como MacPorts y similares en otros sistemas Unix.