Espacio de 1 píxel entre la parte superior de la ventana y la barra de menú

Este parece ser el diseño de la ventana de Safari. Safari (y otras aplicaciones de Apple) tienen un borde de sombra gris en el tema oscuro y negro en el tema claro:

Parece que el color del borde no se ve afectado por el fondo - aquí está el modo oscuro con un fondo de pantalla colorido y el borde sigue siendo gris.

Mientras que Firefox mantiene un borde negro para ambos temas y así no se muestra en modo oscuro.

Mirando otras aplicaciones parece que hay una mezcla. Word actúa como Safari mientras que ITerm2 actúa como Firefox.

No parece haber ninguna manera de eliminar esto en Mojave - ver esta pregunta . Las correcciones/ajustes más antiguos (como Alternar las sombras de OSX ) no funcionan más.

Sí, lo resuelvo coloreando la parte superior de mi escritorio para que coincida con el color de la sombra.

De este modo, no hay que preocuparse por el hueco.