Las similitudes entre estas tres aplicaciones es que todas muestran "Actualizando..." en la barra de título cuando envían/reciben datos. ¿Tal vez algo relacionado con los servicios de sincronización o el Agente de Calendario? Podría ayudar restablecer los servicios de sincronización .
Los problemas que sólo ocurren en su cuenta de usuario (y no en otras) están probablemente relacionados con las preferencias u otros datos dentro de esa cuenta. Un buen lugar para empezar es la carpeta ~/Library/Preferences. Realizando una búsqueda por mitades en el contenido de ese directorio es una buena manera de atacar los problemas. Si el problema no está en la carpeta de Preferencias, es muy probable que esté en algún lugar de ~/Biblioteca (¿Calendarios?).
Si tienes suerte, la actualización a Mavericks no utilizará la misma funcionalidad (es decir, no leerá las preferencias corruptas)... Sin embargo, es posible que sigas experimentando los problemas en ese sistema operativo si instalas sobre tu entorno de usuario actual.