Una pregunta difícil.
No sé cuánto tiempo ha estado sucediendo esto, pero lo noté hace poco. Mis ventanas semitransparentes tienen un cuadrado/ventana "falso" debajo de ellas, que es visible (también proyecta una sombra, pero sólo cuando la ventana está en primer plano.
Captura de pantalla: 
(la ventana de textedit sirve sólo como un fondo blanco).
Video que muestra el comportamiento:
http://cl.ly/132M2T0p3j0E210d0S2K
Inicialmente pensé que esto era sólo TextMate, pero me di cuenta de esto en terminal.app también (semi-transparente también).
Estoy corriendo 10.6.6, no tengo ningún hackeo "extraño" o gestores de entrada instalados AFAIR. Entiendo que este es probablemente un error muy exótico, así que herramientas que puedan ayudarme a rastrear la causa son bienvenidos, y aceptaré gustosamente tal respuesta.
Gracias de antemano,
A.
