En general, la mayoría de macOS aplicaciones se programan para que se muestre el icono en el Dock cuando se está ejecutando (las excepciones son las aplicaciones que muestran un ícono en la barra de Menú cuando se ejecuta).
Si el icono de una aplicación no se añade de forma permanente a la base, el icono permanece visible mientras se está ejecutando. El icono desaparece de la base al salir de la aplicación mediante la selección de Nombre de la Aplicación → Salir Nombre de la Aplicación desde el menú de la aplicación, o invocando el atajo de teclado Comando + Q con la app en el foco.
Así, la única manera de quitar el icono de una aplicación de la base está por salir de ella.
Algunas aplicaciones se programan para que automáticamente se cierra cuando la última visible que se cierre la ventana haciendo clic en el botón cerrar
en la parte superior derecha, o cuando el cierre de la ventana de atajo de teclado Comando + W se invoca.
Por lo tanto, el desarrollador de la aplicación para elegir cual de los dos el comportamiento de implementar, y no puede ser cambiado por el usuario.