FaceID y TouchID se almacenan solo de forma local en el dispositivo de Seguridad del Enclave y nunca se envía a través de la red.
Como Justin Bote escribe en "¿Qué Es Apple "Secure Enclave", Y ¿Cómo Proteger Mi iPhone o Mac?" en How-To Geek:
El Secure Enclave botas por separado del resto de su dispositivo. Se ejecuta su propio micronúcleo, que no es directamente accesible por el sistema operativo o los programas que se ejecutan en el dispositivo. Hay 4 mb de flashable de almacenamiento, la cual es utilizada exclusivamente para almacenar 256-bit de curva elíptica claves privadas. Estas claves son únicas a su dispositivo, y no se sincroniza con la nube o incluso visto directamente en su dispositivo principal del sistema operativo. En su lugar, el sistema pide el Secure Enclave para descifrar información utilizando las teclas.
Así, su FaceID (o TouchID para que la materia) está atado a un dispositivo específico y no puede ser restaurada en un dispositivo diferente a partir de una copia de seguridad.
Usted puede leer más acerca de esto en el artículo de la Wikipedia en FaceID.