Sí, ciertamente es posible. Apple no debería rechazarlo por este motivo. Está totalmente permitido tener diferentes marcas, esquemas de color, etc. según el usuario conectado.
Puede encontrar las directrices de revisión de la App Store aquí:
https://developer.apple.com/app-store/review/guidelines/
Como verás no hay ninguna sección que permita ni prohíba explícitamente lo que quieres conseguir. Esto significa que lo que quiere hacer se considerará normalmente correcto. Asegúrate de cumplir con la sección 5.2 y no utilices propiedad intelectual (logotipos, textos de marca, etc.) que no te corresponde utilizar.
Sin embargo, si también ofrece diferentes funcionalidades, asegúrese de proporcionar al equipo de revisión de Apple todas las funcionalidades. No está permitido que la aplicación se revise con un conjunto de funcionalidades y que luego los usuarios dispongan de un conjunto completamente diferente de funcionalidades en la aplicación después de iniciar sesión con un conjunto específico de credenciales "secretas".
También asegúrate de cumplir con la sección 3.1.1 sobre las compras dentro de la aplicación, si quieres que el usuario no sólo tenga una marca diferente, sino que también tenga diferentes funcionalidades después de iniciar sesión.
Las capturas de pantalla en la App Store no tienen que mostrar todos y cada uno de los tipos de marca o combinación de colores posibles en la aplicación. No hay ningún requisito al respecto, por lo que no deberías tener problemas en este sentido. Sin embargo, las capturas de pantalla deben ser una representación real de la aplicación en sí, es decir, por ejemplo, tomar capturas de pantalla de uno de los esquemas de color / marca y usar eso. Es decir, no utilices capturas de pantalla que sean diferentes de lo que realmente es posible obtener dentro de la aplicación si tienes las credenciales adecuadas.