Se sincronizarán (o deberían sincronizarse) entre dispositivos. si utilizas la Fototeca de iCloud de lo contrario, por ejemplo, cuando se sincroniza sólo el PhotoStream, los favoritos no se sincronizan.
Acabo de probar esto en un dispositivo que ejecuta iOS 12.1.3 y MacOS Mojave 10.14.3 favoreciendo una foto en la aplicación Fotos de iOS, y no sólo la foto apareció en el álbum Favoritos en Photos.app en Mac, el álbum Favoritos se creó automáticamente en ambos lugares. (No uso Favoritos, pero parece que me funcionan).
Según Artículo de soporte de Apple para la Fototeca de iCloud las ediciones sí se sincronizan entre dispositivos. También lo acabo de confirmar recortando una foto en mi Mac y viendo cómo aparece la foto recortada en mi dispositivo iOS.
Nota: si estás intentando sincronizar favoritos entre dispositivos mediante una sincronización directa como iTunes, no puedo describir cuál es el comportamiento correcto, ya que no dispongo de una configuración con la que probarlo actualmente, ni he podido encontrar información en el sitio web de soporte de Apple.