¿Por qué mi aplicación Fotos muestra más de 47 GB de espacio utilizado cuando mi biblioteca de fotos está vacía?

No hay suficiente información aquí para una respuesta definitiva (no es culpa tuya, si tuvieras esa "información definitiva" no estarías haciendo la pregunta :). Dicho esto, voy a suponer que hay una fototeca "huérfana" en algún lugar de tu HD que ha caído en una grieta. Lo digo por algo que me ocurrió después de que Apple "actualizara" iPhoto a Photos no hace mucho tiempo. En mi caso esto ocurrió después de "migrar" las cuentas de usuario de un Mac antiguo a uno más nuevo. Recordarás que iPhoto te permitía crear tantas bibliotecas como quisieras, y con el tiempo, perdí el rastro de algunas de ellas. Esto es sólo una suposición, pero espero que ayude.

Parece que Apple puede haber sido un poco ambigua en cuanto a cómo manejar la eliminación de los almacenes de datos que contienen imágenes. No parece haber un método único que funcione en todas las diferentes aplicaciones, dispositivos y escenarios de almacenamiento. Si no has migrado una cuenta de usuario (o "actualizado" de iPhoto a Photos a tu Mac de 2017, o la teoría de la "biblioteca huérfana de iPhoto" no se sostiene, quizás alguna de las siguientes te dé alguna pista para descubrir qué método te funcionará.

Puede que merezca la pena leer este hilo

Y de Foro de soporte de Apple: esto podría valer la pena revisarlo:

Las fotos y los vídeos eliminados se colocan en el álbum de Eliminados recientemente del dispositivo, donde permanecen durante 30 días. Después, los elementos se eliminan permanentemente de todos los dispositivos configurados para la Fototeca de iCloud.

Puedes eliminar elementos de tus dispositivos antes de que se cumpla el plazo de 30 días. En su dispositivo iOS, en el álbum Eliminados recientemente, pulse Seleccionar, pulse para seleccionar uno o más elementos, pulse Eliminar y, a continuación, pulse Eliminar [elementos]. Para eliminar fotos en tu Mac, consulta Accede a tus fotos y vídeos en cualquier lugar con la Fototeca de iCloud en la Ayuda de Fotos para Mac.

Y de otro post sobre el tema:

1. Abre la aplicación Fotos en tu Mac.
2. Haz clic en la carpeta de Borrados Recientes en tu barra lateral.
3. Haz clic en las imágenes o vídeos que quieras eliminar definitivamente.
4. Haga clic en el botón Eliminar de la parte superior derecha. Aparecerá un aviso en la pantalla: ¡sólo tienes que pulsar eliminar y ya está!