Software desinstalado de cerveza todavía en $PATH

Homebrew le gusta crear enlaces simbólicos desde /usr/local/bin/ a /usr/local/Cellar/.

Puede ver si este es el caso por ejecutar: ls -l /usr/local/bin/bowtie2.

Que debe devolver una línea con una flecha sintaxis (->) como este:

/usr/local/bin/bowtie2 -> ../Cellar/bowtie2/<someversion>/bin/bowtie2

Si ese es el caso, entonces usted puede simplemente eliminar el enlace simbólico roto con: rm /usr/local/bin/bowtie2 (puede necesitar un prefacio que con sudo dependiendo de la propiedad de /usr/local/bin/. Es el enlace simbólico roto que está causando which todavía espectáculo bowtie2 como se encuentra en /usr/local/bin/.

A continuación, puede mover el nuevo binario para bowtie (que puede descargar desde SourceForge) en /usr/local/bin/ o a cualquier otra carpeta en su CAMINO.

trate de:

ls -la /usr/local/bin/ | grep bowtie2

así como

find /usr/local | grep bowtie2

esto le dará toda la información

el binario se suelen colocar aquí (* es sólo para reemplazar el número de versión):

/usr/local/Cellar/PROGRAMNAME/*/bin/

que en tu caso:

/usr/local/Cellar/bowtie2/*/bin/