El color rojo significa que el programa ya no responde al sistema operativo. Esto suele deberse a que el programa se ha bloqueado, pero también puede ser que se deba a que el programa está ralentizado por la espera del disco, la asignación de memoria o algo similar. Si ese es el caso, el programa volverá a aparecer en negro, cuando sí responda.
En tu caso parece razonable pensar que efectivamente el Flash Player se ha colapsado, ya que se supone que no está haciendo mucho, si no tienes ninguna página Flash abierta en tu navegador.
Puede hacer clic en el elemento de Flash Player en el Monitor de actividad y pulsar el icono de la cruz circular en la barra de herramientas, lo que obligará a matar el programa, liberando los recursos para que los utilicen otros programas.
Si no has actualizado Flash Player y/o tu navegador recientemente, te sugiero que actualices a la última versión que podría solucionar el problema.