Cómo utilizar el g++ casero

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Cómo utilizar el g++ casero

Preguntado el 22 de Febrero, 2018: Cuando se hizo la pregunta
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Intento hacer y conseguir:

Makefile:81: "*** WARNING g++ minor version <7 ***"
mkdir -p obj_linux/codebase/spoa/src/
g++ -static-libgcc -static-libstdc++ -D__cplusplus=201103L -I"./src/" -I"/usr/include/" -Icodebase/argparser/src -Icodebase/seqlib/src -Icodebase/samscripts/src -Icodebase/spoa/src -O3 -fdata-sections ->ffunction-ections -c -fmessage-length=0 -ffreestanding -fopenmp -m64 ->std=c++11 -error=return-type -pthread -march=native -o obj_linux/codebase/spoa/src/alignment.o codebase/spoa/src/alignment.cpp
clang: error: unsupported option '-fopenmp'
make: *** [obj_linux/codebase/spoa/src/alignment.o] Error 1
lahmersk-iml13:racon lahmersk$ whereis g++
/usr/bin/g++

Tengo una instalación casera de 7.3 en /usr/local/Cellar/gcc

He intentado exportar PATH en .bash_profile con:

# gcc location
export PATH=/usr/local/Cellar/gcc:$PATH

El directorio de mi bodega tiene:

lahmersk-iml13:Cellar lahmersk$ ls
aragorn     gdbm        libmpc      parallel    sqlite
barrnap     gmp     llvm        prodigal    tbl2asn
blast       hmmer       lmdb        prokka      xz
cmake       infernal    minced      python3
eigen       isl     mpfr        qt
gcc     libffi      openssl     readline

y gcc lo es:

lahmersk-iml13:Cellar lahmersk$ cd gcc
lahmersk-iml13:gcc lahmersk$ ls
7.3.0

Mi perfil bash actual es:

# Homebrew location
export PATH=/usr/local/bin:/usr/local/sbin:$PATH

# Centrifuge location
export PATH=/Users/lahmersk/centrifuge:$PATH

# Spades location
export PATH=/Users/lahmersk/SPAdes-3.11.1-Darwin/bin:$PATH

# Bowtie2 location
export PATH=/Users/lahmersk/bowtie2-2.3.4.1:$PATH

# Pilon location
export PATH=/Users/lahmersk/pilon-1.21:$PATH

# Prokka location
export PATH=/Users/lahmersk/prokka/bin:$PATH

# Barrnap location
export PATH=/Users/lahmersk/barrnap/bin:$PATH

# gcc location
export PATH=/usr/local/Cellar/gcc:$PATH

cuando hago sudo vi /etc/rutas me sale:

/usr/local/bin
/usr/bin
/bin
/usr/sbin
/sbin

Me vendría bien algo de ayuda. ¿Qué otra información puedo proporcionar?

Preguntado el 22 de Febrero, 2018 por K Lahmers

0 votos

g++ se toma de /usr/bin Así que esta no es la versión casera. Algunos detalles más sobre los paquetes brew instalados, las definiciones PATH, etc. podrían ayudar.

Comentado el 22 de Febrero, 2018 por Matthew A. Flinchbaugh

0 votos

2 preguntas 1) ¿por qué quieres g++ clang es tan bueno y más fácil de trabajar en el Mac 2) Usted entorno no importa que va a utilizar la ruta de g ++ en que makefiles o otros construir scripts

Comentado el 22 de Febrero, 2018 por yoliho

Answer 1

1 Respuestas

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3voto

Matthew A. Flinchbaugh Puntos 41

No debería ser necesario añadir el Cellar a su camino para esto. Pero Homebrew añade un sufijo de versión al gcc para evitar conflictos de nombres con el estándar gcc :

pse@Mithos:~$ ssh verence@localhost brew install gcc
[...]
==> Downloading https://homebrew.bintray.com/bottles/gcc-7.3.0.high_sierra.bottle.1.tar.gz
==> Downloading from https://akamai.bintray.com/d0/d09669e3679bb54448f00cda4bf520e631f7487f132ebfe6e0d2f6ecdcd5f6e0?__gda__=exp=1519315844~hmac=df4f6f9b82a2ac5fb5465be3f9dc91c0c3eea0c254e894113edf5fcc2b640c57&response-content-disposition=attachment%3Bfilename%3D%22gcc-7.3.0.high_sierra.bottle.1.tar.gz%22&response-content-type=application%2Fgzip&requestInfo=U2FsdGVkX1-mCWpMqQTGrxnTfILcUZz-NvVoQyGOGSnI4iWY_Z2bJghjhAR-xgGu9cDwVXgE9DLumAnLcf1a5kZAz724Fowtbckow4p_nVq39TQR8WNf4jMP4z7Sql3NQ2dFr1pLXQ3paB2FUCf1_A&response-X-Checksum-Sha1=d492b86b3ba112920165af9df80dd793df1d8f46&response-X-Checksum-Sha2=d09669e3679bb54448f00cda4bf520e631f7487f132ebfe6e0d2f6ecdcd5f6e0
==> Pouring gcc-7.3.0.high_sierra.bottle.1.tar.gz
  /usr/local/Cellar/gcc/7.3.0: 1,486 files, 284.9MB

pse@Mithos:~$ ll /usr/local/bin/g*-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  29 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/g++-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/g++-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  29 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcc-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcc-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  32 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcc-ar-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcc-ar-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  32 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcc-nm-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcc-nm-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  36 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcc-ranlib-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcc-ranlib-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  30 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcov-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcov-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  35 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcov-dump-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcov-dump-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  35 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gcov-tool-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gcov-tool-7
lrwxr-xr-x  1 verence  admin  34 Feb 22 16:59 /usr/local/bin/gfortran-7@ -> ../Cellar/gcc/7.3.0/bin/gfortran-7

Así que el compilador que se busca puede ser invocado con g++-7 .

Respondido el 22 de Febrero, 2018 por Matthew A. Flinchbaugh (41 Puntos )

0 votos

¿Cómo puedo invocar este compilador? He intentado hacer CXX=/usr/local/Cellar/gcc/g++-7.

Comentado el 22 de Febrero, 2018 por K Lahmers

1 votos

CXX=/usr/local/bin/g++-7

Comentado el 22 de Febrero, 2018 por Matthew A. Flinchbaugh

0 votos

He ejecutado esto y luego intenté hacer resultando en el mismo mensaje de fallo. Whereis g++ todavía apunta a /usr/bin/g++

Comentado el 22 de Febrero, 2018 por K Lahmers

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