El Macbook sólo arranca en recuperación, ¿cómo copiar los archivos en otro disco duro y arrancar desde él?

Mi Macbook Pro sólo arranca en recuperación después de actualizar Disk Utility desde la App Store. En la Utilidad de Discos en el Modo de Recuperación, mi disco no puede ser revisado en busca de errores y no puede desmontar. (Creo que también reconoce la existencia del sistema de archivos pero no puede verificarlo o algo similar) He sacado el disco duro de mi dispositivo y he utilizado una caja de discos y puedo ver mis archivos. ¿Cómo puedo copiar estos archivos a otro HD/SSD y arrancar desde él (con éxito) en MacOS? Tengo un encriptador de archivos que encripta algunos de mis archivos, así que necesitaría que todos mis datos de aplicaciones/archivos permanecieran cuando copie los archivos y arranque la unidad.