Tabla de particion dañada en disco duro

Hola Tengo un disco duro de 2 Teras puesto en modo esclavo y particionado en 2 unidades. Tiene un par de meses de uso. Pues luego de un reinicio del antivirus, luego de una actualización, la PC dejo de reconocer una de sus particiones, no detecta su tamaño y cada vez que trato de entrar en ella el explorador de archivos se cuelga, igual sucede con la el administrador de discos de windows y con el Hireens Boot. Un programa de reparacion me dio el diagnostico de que esta dañada la tabla de particiones. No me interesa perder la información del disco, quiero repararlo de modo que quede lo mejor posible, ¿seria formateando la partición dañada o formateando todo el disco?, formatear cada partición por separado es simple, pero ¿cual es el modo de formatear todo el disco que tiene 2 particiones? De antemano les voy a agradecer mucho su ayuda Saludos