¿Hacer el MacBook Pro Thunderbolt compatible con GPUs externos funcionan con Boot Camp?

Sí, en general, externa Gpu trabajo con Boot Camp bien.

En el caso específico, usted necesita para asegurarse de que tiene los controladores de Windows para su eGPU y que su gabinete está apoyado por Boot Camp. Principalmente, este no es un problema en la práctica.

Tenga en cuenta que esto puede requerir un poco de trasteo para conseguir este trabajo en algunos casos. Por ejemplo, observe que es posible que no funcione si se conecta el eGPU en el lado izquierdo puertos Thunderbolt en el MBP, pero funciona perfectamente en cuando se conecta en el lado derecho puertos Thunderbolt (o viceversa).

Usted puede encontrar una lista de guías del usuario para la configuración con varias tarjetas gráficas y anexos: eGPU.io - Usuario Guías de Implementación

Aquí tienes una buena guía que detalla algunos de los "chanchullos" que puede ser necesario: eGPU.io - Boot Camp eGPU Guía de Instalación para Thunderbolt 3 MacBook Pro