¿cómo dividir un mp4 en clips separados?

Tengo un vídeo .mp4 de 3 horas de duración que tiene pausas sensibles cada 30 minutos más o menos. Quiero exportar esto en múltiples videos de cada sección, pero se han encontrado con nada más que problemas tratando de hacerlo. Esto no es algo que haga a menudo, así que no quiero invertir en herramientas comerciales para esta tarea, pero todavía no puedo encontrar ninguna herramienta gratuita capaz de hacer este trabajo.

Realmente preferiría cortar esto sin tener que decodificar y recodificar los archivos de nuevo. Me gustaría simplemente marcar las secciones que quiero, y escupirlas como .mp4s independientes. Sin otras ediciones, sin correcciones, sin efectos, sin nada... sólo cortar y exportar sin ningún cambio de formato.

Pensaba que Handbrake podía hacer esto, pero si puede no consigo averiguar cómo. Entonces pensé que tal vez iMovie (10.x como estoy en Mavericks), pero eso ha sido nada más que un dolor de cabeza y parece decodificar toda la película primero antes de trabajar con él de todos modos. Quicktime parece que sólo puede exportar directamente como .mov y no quiero volver a codificar a mp4 de nuevo.

Sigo encontrando programas gratuitos/de código abierto que, o bien son gratuitos de forma muy limitada (como exportaciones de 5 minutos como máximo, o marcas de agua desagradables, etc.) o bien no funcionan en Mavericks. ¿Lo que quiero hacer no es posible sin software comercial? ¿Es realmente tan difícil dividir un mp4 largo en varios más cortos?