Cualquier correo electrónico que tengas almacenado en tu Mac desde la aplicación Mail se encuentra en la carpeta de la biblioteca de tu cuenta de usuario. Más concretamente, en macOS Sierra puedes acceder a tus datos de correo de la siguiente manera:
- Asegúrate de que estás en el Finder
- Mantenga pulsada la tecla option clave
- Haga clic en el menú Ir y seleccione Biblioteca
- Se abrirá la carpeta Biblioteca de su cuenta de usuario (ahora puede soltar el option clave)
- Dentro de esta carpeta se encuentra una carpeta de Correo. Ésta contiene todos los datos de Mail almacenados en su Mac.
Ahora, asumiendo que tienes copias de seguridad de Time Machine, todo esto debería estar ya respaldado. Sin embargo, si no lo tienes, puedes copiar esta carpeta de Mail en un par de unidades USB para mantenerla a salvo hasta que resuelvas tu problema con la aplicación de Mail.
NOTA: No queda claro en tu pregunta cómo has actualizado a macOS Sierra, ni qué tipo de cuenta de correo electrónico tienes. Por lo tanto, no podemos aconsejar cuántos datos, si es que hay alguno, tienes en tu carpeta de Mail.
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Qué tipo de servidor de correo electrónico utilizas, por ejemplo, IMAP/POP, etc. (La respuesta obvia a esta pregunta es restaurar a partir de una copia de seguridad; si no tienes una copia de seguridad, no hagas nada más hasta que tengas una).