Se cargará. No es peligroso. Ese adaptador de corriente está diseñado para suministrar HASTA 87W. Si le enchufas un tbMBP de 15", consumirá los 87W previstos. Si le enchufas un MBP de 13", el MBP sólo consumirá 61W, aunque el adaptador pueda suministrar 87W. Lo mismo ocurre con tu iPhone. Consumirá la cantidad de energía que necesite (unos 10 W, según creo) y el adaptador no tendrá ningún problema en suministrar sólo esa cantidad de energía.
Sin embargo, es interesante señalar que los adaptadores de enchufe USB que vienen con iPhones proporcionan sólo 5W, iPhones son capaces de tirar de más potencia, y se cargará más rápido cuando se conecta a un iPad (10W) o tbMBP adaptador de enchufe USB.