El carácter de tilde es un atajo para el directorio home del usuario actualmente logueado (en UNIX-como sistemas operativos).
En las rutas de directorios de iCloud se incluye también.
Por ejemplo:
com~apple~CloudDocs
o
com~apple~mail
¿Qué es lo que significa allí?
Y en general: ¿Cuál es la razón de estas rutas de archivo raras?
La razón para nombrar cosas como que a partir de dominio de nivel superior y va a estar más y más específico es tenerlos agrupados automáticamente al listado de ellos. Esta es una práctica común que cosas como las clases de java o archivos de preferencias (pero por lo general separados por puntos).
El uso de la tilde no tiene nada que ver con el directorio de inicio de la tilde. Supongo que es sólo uno de los últimos símbolos de la norma charset sin un especial significado en este contexto, mientras .:;<>$/"*# y así sucesivamente pueden tener conflictos con diferentes interpretaciones.
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